Pomalidomide-PEG2-azide

目录号: GC61617纯度: >99.00%

Pomalidomide-PEG2-azide是一种合成的E3连接酶配体-连接子缀合物,其中包含蛋白水解靶向嵌合体(PROTAC)技术中使用的基于Pomalidomide的cereblon配体和2单元PEG连接子。 Pomalidomide-PEG2-azide是一种点击化学试剂,它含有叠氮基团,可以与含有炔基的分子发生Cu(I)催化的叠氮化物-炔环加成反应(CuAAC)。


Pomalidomide-PEG2-azide
Cas No.: 2267306-14-7
规格价格库存数量操作
50 mg¥3,600.00现货
1
100 mg¥5,850.00现货
1
500 mg¥14,850.00现货
1

文献被引

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  • Nature cover
    Nature
    641, 529–536 (2025)
  • Nature cover
    Nature
    628, 630–638 (2024)
  • Nature cover
    Nature
    632, 686–694 (2024)
  • Nature cover
    Nature
    618, 1017–1023 (2023)
  • Nature cover
    Nature
    610, 366–372 (2022)
  • Cell cover
    Cell
    187(9):2288-2304 (2024)
  • Cell cover
    Cell
    183(7):1867-1883 (2020)
  • Science cover
    Science
    388(6745) (2025)
  • Science cover
    Science
    387(6739) (2025)
  • Science cover
    Science
    387(6734) (2025)
  • Cell Research cover
    Cell Research
    35, 97–116 (2025)
  • Cell Research cover
    Cell Research
    34, 683–706 (2024)
  • Cell Research cover
    Cell Research
    33, 273–287 (2023)
  • Cell Research cover
    Cell Research
    33, 546–561 (2023)
  • Cell Research cover
    Cell Research
    33, 904–922 (2023)
  • Cell Research cover
    Cell Research
    31, 1291–1307 (2021)

产品描述 Description

Pomalidomide-PEG2-azide is a synthetic E3 ligase ligand-linker conjugate that includes a Pomalidomide-based cereblon ligand and a 2-unit PEG linker used in proteolysis targeting chimeras (PROTAC) technology[1]. Pomalidomide-PEG2-azide is a click chemistry reagent containing an azide group that can react with alkynyl-containing molecules via a Cu(I)-catalyzed azide-alkyne cycloaddition (CuAAC) reaction[2].

Click chemistry is a versatile reaction that can be used for the synthesis of a variety of conjugates. Virtually any biomolecule can be easily labelled with small molecules, such as fluorescent dyes, biotin, etc using click chemistry method.

Click chemistry reaction takes place between two components: azide and alkyne (terminal acetylene). Both azido and alkyne groups are nearly never encountered in natural biomolecules. Hence, the reaction is highly bioorthogonal and specific. 

References:

[1] Zhang F, Wu Z, Chen P, et al. Discovery of a new class of PROTAC BRD4 degraders based on a dihydroquinazolinone derivative and lenalidomide/pomalidomide[J]. Bioorganic & medicinal chemistry, 2020, 28(1): 115228.

[2] Singh M S, Chowdhury S, Koley S. Advances of azide-alkyne cycloaddition-click chemistry over the recent decade[J]. Tetrahedron, 2016, 72(35): 5257-5283.

Pomalidomide-PEG2-azide是一种合成的E3连接酶配体-连接子缀合物,其中包含蛋白水解靶向嵌合体(PROTAC)技术中使用的基于Pomalidomide的cereblon配体和2单元PEG连接子[1]。 Pomalidomide-PEG2-azide是一种点击化学试剂,它含有叠氮基团,可以与含有炔基的分子发生Cu(I)催化的叠氮化物-炔环加成反应(CuAAC)[2]

点击化学是一种多功能反应,可用于合成各种缀合物。事实上,任何生物分子都可以使用点击化学方法轻松地用小分子标记,例如荧光染料、生物素等。

点击化学反应发生在两种组分之间:叠氮化物和炔烃(末端乙炔)。叠氮基和炔基在天然生物分子中几乎从未遇到过。因此,该反应具有高度生物正交性和特异性。

实验参考方法 Experimental Reference Method

建议使用以下通用方案,对GlpBio生产的带有叠氮化物的炔烃修饰寡核苷酸或DNA进行化学标记。本方案仅提供一个指导,请根据您的具体需要进行修改。

 

1.使用下表计算Click化学标记所需试剂的体积。准备所需的储备溶液(见附录)。

 

试剂 

混合物中的最终浓度

原液浓度

炔烃修饰的寡核苷酸或DNA

Varies (20 — 200 uM)

Varies

叠氮化物

1.5 x (寡核苷酸浓度)

10 mM in DMSO

DMSO

50 vol %

抗坏血酸

0.5 mM

5 mM in water

铜-TBTA络合物

0.5 mM

10 mM in 55 vol % DMSO

 

2.将炔基修饰的寡核苷酸或DNA溶解在水中,置于耐压瓶中。

 3.添加2M三乙胺醋酸盐缓冲液(pH 7.0)至最终浓度0.2M。

 4.添加DMSO,并涡旋混匀。

 5.添加叠氮化物储备溶液(10 mM DMSO中),并涡旋混匀。

 6.向混合物中添加所需体积的5mM抗坏血酸储备溶液,并短暂涡旋。

 7.通过在溶液中鼓泡惰性气体(如氮气、氩气或氦气)30秒进行脱气。

 8.向混合物中添加所需量的10mM铜(II)-TBTA储备溶液(55% DMSO中),用惰性气体冲洗瓶子并关闭瓶盖。

 9.充分涡旋混合。如果观察到显著的叠氮化物沉淀,加热瓶子至80°C并涡旋3分钟。

 10.在室温下静置过夜。

 11. 使用丙酮(用于寡核苷酸)或乙醇(用于DNA)沉淀结合物。充分混合并在−20°C保存20分钟。

 

对于寡核苷酸结合物的沉淀:向混合物中添加至少4倍体积的3%高氯酸锂丙酮溶液(如果混合物体积较大,分成几个瓶子)。

对于DNA结合物的沉淀:向混合物中添加醋酸钠至最终浓度0.3M;添加2.5倍体积的乙醇(或0.8倍体积的异丙醇)。

 12.以10000 rpm离心10分钟。

 13.丢弃上清液。用丙酮(1mL)洗涤沉淀物,以10000 rpm离心10分钟。

 14.丢弃上清液,干燥沉淀物,并通过反相高效液相色谱(RP-HPLC)或聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)纯化结合物。

 

附录。用于点击化学标记和缀合的试剂储备溶液的制备。

5 mM抗坏血酸

准备

将18mg抗坏血酸溶解在20mL蒸馏水中。

贮存

抗坏血酸很容易被空气氧化。该溶液可稳定一天。请使用新鲜的制剂。

10 mM铜(II)-TBTA贮存于55% DMSO中

准备

将50 mg五水硫酸铜(II)溶解在10 mL蒸馏水中。将116 mg TBTA 配体溶解在11 mL DMSO中。混合两种溶液。

贮存

室温保存。溶液可稳定保存数年。

2M 三乙基乙酸铵缓冲液,pH 7.0

准备

将2.78 mL三乙胺与1.14 mL乙酸混合。加水至10mL 体积,并将pH调节至7.0。

贮存

室温保存。溶液可稳定保存数年。

产品文档 Product Documents

Purity:>99.00%

化学性质Chemical Properties

CAS 号
2267306-14-7
SMILES
O=C(NC1=CC=CC(C(N2C(CC3)C(NC3=O)=O)=O)=C1C2=O)COCCOCCN=[N+]=[N-]
分子式
C19H20N6O7
分子量
444.4 g/mol
溶解性
DMSO: 90 mg/mL (202.52 mM)
保存条件
-20°C, protect from light
General tips
请根据产品在不同溶剂中的溶解度选择合适的溶剂配制储备液;一旦配成溶液,请分装保存,避免反复冻融造成的产品失效。
储备液的保存方式和期限:-80°C 储存时,请在 6 个月内使用,-20°C 储存时,请在 1 个月内使用。
为了提高溶解度,请将管子加热至 37°C,然后在超声波浴中震荡一段时间。
Shipping Condition
评估样品解决方案:配备蓝冰进行发货。所有其他可用尺寸:配备 RT,或根据请求配备蓝冰。

计算工具摩尔浓度 / 稀释 / 分子量 / 单位换算 / 体内配方 / 溶解度

g/mol